依照《法務部組織法》第5條第5款及第6款的規定，最高檢察署和臺灣高等檢察署都是法務部的次級機關，彼此不相隸屬。
依照《司法院組織法》第6條的規定，最高法院和臺灣高等法院都是司法院系統所設的法院，彼此不相隸屬。